云空和穆雪飞抬着苏楚侨离开。杉木命人跟踪他们。中村不明白杉木为何放走苏楚侨，只要拿下她们，不信黄鸣锋不来救人。杉木瞟了中村一眼，说道：我是一名武士!坂垣第一次责备杉木为了不值一提的武士尊严，做了一个愚蠢至极的决定。
云空三人没有回谭队长家，而是返回了霞流镇云空家。虽然知道身后有人跟踪，但他们还是不动神色。钟小娴等在云空家。穆雪飞拿出一个针筒。原来，穆雪飞在兰如剑和兰博士纠缠之际，换了针筒。如何才能知道这针筒内是药是毒?钟小娴接过针筒扎进了自己的静脉。云空和穆雪飞、兰如剑三人大惊失色。钟小娴告诉他们，她已经被传染了。众人这才注意到，钟小娴面色发红……
钟小娴把云空三人赶出房间，独自和苏楚侨待在一起。两个小时过去了，兰如剑如坐针毡，他一把推开房门，只见钟小娴喷出一口污血。钟小娴说道：兰博士不是要救人，而是要杀人。
愤怒的兰如剑和云空杀了潜伏在周围监视他们的日本武士。穆雪飞赶往谭队长家通知黄鸣锋。与此同时，潜伏在城里的游击队员回来汇报，兰博士已经被转移到日军总部。
是夜，负责监视云空的武士迟迟没有传回消息。杉木感觉到出事了。她猛然间想到兰博士，立刻致电龟田，提醒他提高警惕，话说到一半，只听得龟田一声惨叫，便没了声音……杉木大惊，率队赶往总部。
日军总部内一片混乱，黄鸣锋等人虏获兰博士，在游击队员的掩护下迅速撤离。杉木来晚了一步，继而杀向霞流镇，云空家也早已人去楼空。
前往谭队长家途中，黄鸣锋突然想到什么，为什么杉木不在日军总部，而是住在济民诊所?济民诊所究竟有什么秘密?黄鸣锋和铁虎、柳迎春三人当即折返。
诊所内有数十名日本武士看守着。黄鸣锋三人杀入诊所。兰博士的助理黄子安眼见着武士们一个个死在黄鸣锋手下，吓得面无人色，闪身钻进兰博士的办公室。黄鸣锋追了进来，黄子安却不见了人影。黄鸣锋怀疑这里有暗道，寻找之下竟发现了抽屉中的一个空的药剂瓶，上面用日文写着：27号病毒。
另一边，铁虎和柳迎春在后院的一间石屋内发现了几十具干枯的尸骨……
军刺第28集剧情介绍众人回到谭队长家。钟小娴的病情比苏楚侨恶化得更厉害。铮铮铁骨的黄鸣锋竟也流下了眼泪。他把那个空药剂瓶给钟小娴看，钟小娴说上面的字是27号病毒，应该是新研发出来的病毒。
被关在柴房的兰博士极力掩饰内心的紧张和慌乱。黄鸣锋和穆雪飞走了进来，要他说出27号病毒的血清在哪里。兰博士矢口否认。气得穆雪飞当即拔出鱼肠剑要杀他。
深夜，兰博士听见门外传来兰如剑和铁虎的争辩声。兰如剑说自己了解哥哥，哥哥从小立志当医生，造福国人，绝不会做日本人的走狗。铁虎说济民诊所那几十具白骨就是最好的证明。兰如剑仍旧不信。兰博士似抓到救命稻草，大声呼喊兰如剑的名字。兰如剑冲进柴房。分别十五年的两兄弟终于相认了。兰如剑问道"为什么家里会受到你病故的电报?""为什么你回国了，却不跟家里联系?兰博士解释说，为了进入美国的研究所，他迫不得才跟家里断了联系。但他没干过任何伤天害理的事，是他的助理黄子安陷害了他。兰如剑半信半疑，心情复杂。
杉木猜到黄鸣锋绑架兰博士，一定是苏楚侨还没死。黄鸣锋还会再回济民诊所寻找血清。杉木在诊所周围设下重兵埋伏。坂垣更为阴毒，他把27号病毒捆绑在五十公斤炸药上，只要黄鸣锋一出现，他就引爆炸药。就算黄鸣锋等人不被炸死，也会感染上27号病毒。
钟小娴和苏楚侨的时间不多了。众人分析下来，济民诊所下面一定有密室，血清应该就存放在那里，干脆杀了兰博士，直接去济民诊所抢夺血清。黄鸣锋不置可否……门外，兰如剑听到铁虎等人要杀哥哥，低头转身离去。他来到柴房外，将两名游击队员打晕。兰如剑对哥哥说："你一直是兰家的骄傲，不要让兰家蒙羞!"兰博士脸上闪过一丝内疚之色，然后翻墙逃走。这时，黄鸣锋和铁虎出现在兰如剑身后。原来，这是黄鸣锋设下的一计，引蛇出洞。兰如剑擦干脸上的泪水，和黄鸣锋、铁虎等人追踪兰博士。
兰博士逃到济民诊所外，忽然想起黄鸣锋说的话："就算我不杀你，鬼子也一定会杀了你!"兰博士掉头往帝国贸易公司方向跑去。黄鸣锋紧紧地跟着兰博士身后……
济民诊所，杉木计算着每一种可能性。据她了解，兰博士是个科学狂人，27号病毒比自己的命都重要，所以，兰博士应该不会将济民诊所的秘密告诉黄鸣锋，但难保兰博士不会上黄鸣锋的当。细菌武器研究基地还有一个出入口在帝国贸易公司。杉木猛然间意识到自己疏忽了这一点，当即和坂垣赶往帝国贸易公司。
兰博士进入帝国贸易公司的暗道。黄鸣锋等人和谭队长的游击队员尾随而入，与基地的日军守卫展开激战。兰博士冲进病毒储藏间，抱起资料想要逃走。兰如剑挡住了他的去路。此时的兰博士仍旧振振有词：杀人的是日本鬼子，他只是一个科学家，27号病毒在人类病毒史上是一个伟大的发明，是他发现了扼制和杀灭它的血清。他将成为流芳百世的病毒学家。兰如剑愕然，兰敬亭已经疯了，他甚至认为那些被他用来做实验的人只不过是小白鼠。兰如剑一把夺过血清，把兰敬亭和27号病毒资料一同反锁在储藏间内。兰敬亭大声呼喊，兰如剑头也不回地消失在他的视线中。
帝国贸易公司外，六名游击队员拼死抵抗，壮烈牺牲。杉木和坂垣就率领日军冲进贸易公司……
