公元1215年，诸国林立，宋蒙金三国成鼎足之势，大蒙古草原上，一股强大的势力正在集结，成吉思汗带着三子窝阔台、四子托雷，发动了对金的战争。成吉思汗和窝阔台与金军正面激战之时，金军绕道偷袭了蒙军后方-拖雷的大营，此时托雷的妻子贴尼即将临盆，托雷仅带亲民赶回营救贴尼，数倍于他们的金兵被打退，贴尼在战火中生下男婴，托雷为他取名忽必烈。
九年以后，忽必烈看书时被兄长嘲笑，书被抢走后忽必烈上马追赶，他在途中看到贵由打阔端时上前帮忙打架，贵由被踢翻在地上，贵由母亲路过时看到将他带走。忽必烈让弟弟阿里不哥去拿大饼时被帖尼发现，帖尼罚忽必烈多跪一个时辰。马官库而达的女儿伊娜是忽必烈的好朋友，她是草原上美丽的小女孩儿。
公元1224年，九岁的忽必烈在故乡和林迎回了在外征战、阔别四年之久的成吉思汗和其率领的蒙古大军。忽必烈不慎骑上烈马时被父亲拖雷制服，成吉思汗答应亲自教他最好的马术，成吉思汗清楚只有人马合一才能驰骋天下，忽必烈自幼时就被成吉思汗认可，称必成大器。成吉思汗准备征服西夏之后对付西域，他想让人培养一些新马种。
成吉思汗对于长子和二子的争执感觉到痛心，他用自己办法化解了两人的矛盾。成子思汗对孙子们的狩猎很满意，他用奖赏看出了他们的选择，蒙哥想像哲别一样当一名神箭手，他选择了强弓，忽必烈选择了一串佛珠，只有那个家里没有。成吉思汗向阿律楚材问起看法，他们都都清楚忽必烈是可造之才。公元1226年，蒙古军队通过了战略准备后针对西夏发动了浩大的战争，对于忽必烈和贵由来说具有重大的意义。
成吉思汗对于西征志在必得，忽必烈和贵由也在随军征战的队伍里，他们将在战争中得到历练。攻打西夏的蒙古军队受到顽强蝗抵抗，几场遭遇战后没取得太大优势，而此时成吉思汗的身体愈发虚弱，但他依然在坚持指挥战斗，直至将西夏的中兴城形成合围之势，如果不能攻下城池，蒙古大军将面临困难。唐兀惕砍了蒙古使者带去信函给成吉思汗，成吉思汗看后撕毁，众将没有破敌良策，忽必烈说出自己看法，他提出烧了敌军粮草可破中兴城，成吉思汗采纳的他的建议，忽必烈表现出军事天赋。
西夏中兴城断粮后人心浮动，三日后西夏军队想突出重围时被蒙古军队合围，西夏惨败，蒙古军活捉了敌方主将。
建元风云第2集剧情介绍西夏主将叶绰麻被带到成吉思汗面前，成吉思汗命人砍下他的头颅来祭祀长生天。拖雷收到术赤王的紧急信件，术赤一个月前病逝，托雷不想让父王知道，但已兵分两路传达过去，成吉思汗得知长子术赤大王归天的消息后痛心不已，本就虚弱的身体更是雪上加霜。成吉思汗自知命不久已，他要见四子托雷，他要在儿子之中选一个接替大汗之位的人，成吉思汗给儿孙们留下嘱托，金军驻守潼关难以攻破，他提出假道于宋可攻破金军。成吉思汗了解儿子们的性情，察合台被赐封地，窝阔台有野心，成吉思汗将大汗之位传给他，托雷得到漠北土地和蒙古起家的二十万精兵。
成吉思汗让众官员在窝阔台死后在孙子里选拔合适人选继承汗位，忽必烈是他看好的继承人。公元1227年，成吉思汗病故于鄂尔多斯，八年后，忽必烈已经慢慢走出爷爷病逝的悲痛，他的聪明才华让大家认为忽必烈是草原上的雄鹰，但他万万没想到这一年在感情上受到深深的打击。
蒙古套马比赛开始，忽必烈和众兄弟们一起参加，伊娜在一旁观看，忽必烈率先套住头马，众人拍手鼓掌，忽必烈上马后驯服烈马并成功登台。忽必烈因表现突出被窝阔台赏赐第一杯酒，窝阔台相信蒙古迟早会征服天下。北方盗贼肆虐，窝阔台命年轻人出兵剿灭，贵由因年纪大而取得领兵之权。
忽必烈和伊娜相互都有好感，他答应她在打仗归来后迎娶她，伊娜也愿意等他回来，她还亲自为他缝制了袍子，伊娜为忽必烈送行。取律楚材向窝阔台汇报达兰喀喇的动向，窝阔台准备用联姻的办法来对待他们，伊娜成了嫁给达兰喀喇王子的人选，她知道后非常难过，但王命难违，伊娜带着忽必烈送的匕首出发，她用忽必烈送的匕首在他们约会的溪水旁自杀。
贵由率军发现盗贼老巢后安排三路人马进攻过去，忽必烈建议贵由等其他两路兵马到后再发动攻势，但贵由不听，贵由被盗贼包围，忽必烈救他于危难之间，其他两路人马到后盗贼望风而逃。忽必烈回去后受到重赏，他的几个兄弟也被封赏，贵由的表现让窝阔台并不满意。马官库而达被赏赐牛羊百头。
